Vorab: Sie müssen die Umgebungsvariable CATALINA_OPTS erweitern:

CATALINA_OPTS="... -DMODULE_PFAD=/var/lib/tomcat9/webapps/superx/WEB-INF/conf/edustore/db/module ..."

Unter Ubuntu Linux liegt das in der Datei

/etc/default/tomcat9

dort die Variable

JAVA_OPTS="... -DMODULE_PFAD=/var/lib/tomcat9/webapps/superx/WEB-INF/conf/edustore/db/module ..."

Danach muss man Tomcat neu starten.